在《火影忍者》中，自来也与佩恩的对决是整部作品的重要篇章之一。这场战斗不仅是实力的较量，更是信念与意志的碰撞。

故事发生在木叶村被佩恩六道彻底摧毁之后，自来也得知了长门带领佩恩袭击村子的消息，毫不犹豫地赶往战场。作为鸣人的师父，他深知佩恩背后隐藏着巨大的秘密，而这一切都与幼年的长门有关。在与长门的交手中，自来也展现了其强大的体术、忍术以及对仙人模式的掌控，但面对佩恩那近乎完美的轮回眼能力，他显得力不从心。

尽管如此，自来也并未放弃。他用尽全力拖延时间，试图通过对话唤醒长门内心的良知。然而，长门早已被仇恨蒙蔽双眼，无法接受自来也传递的信息。最终，在一场激烈的战斗后，自来也为了保护小南和收集情报，不惜牺牲自己跳入深海。他的离去不仅震撼了所有人，也为鸣人后来的成长埋下了伏笔。

这场战斗充分体现了自来也作为一名忍者的坚韧与无私。他用自己的生命诠释了什么是真正的师徒情谊，同时也揭示了和平与爱的重要性。正是这份精神激励着鸣人在未来承担起拯救世界的重任。