芒果进化的新见解研究揭示芒果属内存在广泛的杂交

一个研究小组研究了 14 个物种的整个叶绿体基因组和核基因序列，对芒果物种的遗传多样性和杂交起源有了新的认识。他们利用芒果属内的进化关系，揭示了物种间广泛的杂交，并为育种和保护工作提供了启示。

印度芒果，俗称芒果，是芒果属中栽培最广泛的物种，该属属于漆树科，共有 69 个物种。芒果是全球主要的水果作物，印度的产量居世界首位，其次是印度尼西亚、墨西哥、中国和巴基斯坦。虽然大多数芒果属物种是根据物理特征来识别的，但越来越多的证据表明，一些物种可能起源于杂交种。这一发现有可能改变人们对芒果进化及其遗传多样性的理解。

2024 年 10 月 12 日发表在《热带植物》上的一项研究为育种者提供了更精确的基因图谱，以识别和选择所需的性状，从而有可能开发出能够更好地抵御环境挑战的新芒果品种。

该研究采用 Illumina 测序对来自 14 个芒果属植物的 19 个样本的叶绿体基因组进行分析，产生了 55,999,560 到 181,601,786 个原始读取，平均读取长度为 150 bp。

在修剪至 Phred 评分 >20 后，每个样本的数据大小超过基因组大小的20 倍，使其适合叶绿体组装。NCBI 还提供了五个物种的附加数据。

使用 Get Organelle 流程和 Clone Manager Professional 9，将叶绿体基因组与芒果的参考基因组进行比对。结果显示，不同物种的叶绿体基因组大小范围为 151,752 至 158,965 bp，具有典型的四分体结构和 115 个基因(80 个蛋白质编码基因、31 个 tRNA 基因、4 个 rRNA 基因)。

尽管基因组大小各异，但一些物种(例如 M. indica 的三个栽培品种和两个 M. laurina 样本)具有相同的叶绿体基因组。

在某些物种中，我们发现了微小的结构差异，例如两个 M. odorata 样本，由于非编码区域的缺失而表现出 6 bp 的差异。

核基因系统发育的比较分析表明，遗传聚类为不同的分支，表明存在密切的进化关系，尤其是野生物种(如 M. lalijiwa 和​​ M. applanata)与驯化的 M. indica 之间。叶绿体和核基因树之间的差异表明该属内发生了杂交事件。

据该研究的高级研究员罗伯特·亨利博士称，“我们的研究提供了一个详细的遗传框架，有助于了解杂交如何塑造芒果属。物种间基因流动的证据不仅增强了我们对芒果进化的了解，而且对旨在提高果实质量和抗逆性的芒果育种计划也有实际应用。”

这项研究提供了迄今为止最全面的芒果属物种基因分析，揭示了影响芒果进化的杂交过程。

通过加深我们对芒果品种间遗传关系的了解，这些发现为更有效的芒果育种策略和提高作物的适应力铺平了道路，确保了这种深受喜爱的水果在气候变化中继续成功。

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