在神秘果果肉转录组中发现的遗传变异

奇迹果(Synsepalumdulcificum)是奇迹果蛋白的植物来源，奇迹果蛋白是一种天然、无热量的甜味剂。神奇果(Synsepalumdulcificum)原产于西非，一百多年来一直被用来增加当地食品的适口性。

神奇的水果植物呈现出灌木状的结构，每年都会结出多次诱人的红色浆果。这些浆果由大种子、不透明果肉和鲜红色果皮组成。水果的果肉中含有一种称为奇迹蛋白的糖蛋白，它与舌头上的甜味受体结合。

当暴露于酸性刺激时，奇迹蛋白会发生构象变化，即使在没有实际糖的情况下也会产生强烈的甜味。神秘果的受欢迎源于其有趣的口味调节特性。

从历史上看，神秘果与许多其他热带物种一样，缺乏基础的分子、遗传和基因组学信息，无法充分利用该物种的多样性并创造新的、更有利可图的品种。然而，最近已经出版了有关该物种的优秀资源。叶绿体基因组大小为1.6Mb，共有133个基因，其中包括88个蛋白质编码基因，是公开的。

神秘果染色体级基因组组装(约550Mb，包含37,911个基因)以及各种神秘果组织的转录组也已提供。然而，大多数神秘果分子研究都集中在神秘果蛋白上，而不是遗传学或多样性分析。

最近的研究报告了来自“桑格利亚汽酒”、“朱红”、“火焰”和“樱桃”形态类型的神秘果果肉转录组。共识转录组包括91,856个转录本。映射到奇迹果蛋白基因的读数在单个奇迹果果肉转录组中具有最高的代表性。其他丰富的转录本主要包括代表细胞成分、细胞核和核酸结合以及蛋白质修饰的基因本体类别。

转录组用于设计肌动蛋白、延伸因子1α和miraculin基因的实时定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)引物。qRT-PCR分析表明，神秘果果肉和果皮组织具有最高丰度的神秘果蛋白转录物，尽管其他组织(如叶、根和花)也具有可检测水平的目标序列。

总的来说，这些结果将支持神秘果的发现研究和该物种的最终育种。

神秘果基因组学的进步和对该物种植物育种的兴趣令人鼓舞。SNP标记的开发将有利于该物种的许多研究。本研究中确定的独特SNP集可用于对先前以水果质量和产量为特征的神秘果收藏品进行基因分型。

这将有助于解决先前因未知遗传学而引起的挑战，这些挑战使数据分析的形态类型分组变得复杂。确定的SNP还可用于为非洲的多样性收集创建低成本基因分型测定。此外，位于外显子中的SNP可能具有值得未来研究的生物学意义。

神奇果是一种有趣的物种，得益于研究人员的兴趣。本研究期间进行的基因组学工作将有利于未来旨在该物种遗传改良的研究。神秘果未来的经济机会可能取决于该物种的遗传进步。

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